El día 14 de marzo de 1997 se aprobó el Real Decreto que reorganizó el despliegue periférico de la Dirección General de la Guardia Civil en Zonas, Comandancias, Compañías y Puestos, al objeto de simplificar y racionalizar el mismo y alinearlo con la organización general del Estado (RD 367/1997).
A partir de entonces, se estableció que existirían tantas Zonas de la Guardia Civil como comunidades autónomas (con la salvedad de las ciudades autónomas de Ceuta y Melilla, en las que se constituyen sendas Comandancias), con el objetivo de coordinar los servicios a través de los Delegados del Gobierno y facilitar las relaciones de colaboración con los gobiernos autonómicos y los respectivos cuerpos policiales.
Se suprimieron los escalones orgánicos que eran tradicionales en el Cuerpo de Tercio (englobaba a varias Comandancias) y Línea (englobaba a varios Puestos), asumiendo las funciones que tenían asignadas las nuevas Zonas y las Compañías, respectivamente.
En cuanto a las Comandancias, el Real Decreto remitía al Consejo de Ministros las decisiones que afectan a su despliegue. Se asignó al menos una por provincia en función de las necesidades objetivas, y se mantenía, mientras tanto, la distribución de las Comandancias existente.
En la actualidad, hay 17 Zonas, de las que seis son Zonas-Comandancias por correspondencia con comunidades autónomas uniprovinciales, salvo Madrid por su idiosincrasia particular; 53 Comandancias (solo la provincia de Cádiz está organizada en dos Comandancias, una con sede en Cádiz y otra en Algeciras); 228 Compañías territoriales y fiscales; y 1.958 Puestos Principales, Ordinarios y Auxiliares. Están distribuidos por toda la geografía española y eso permite a la Guardia Civil ser una Institución vertebradora del Estado.
