El 23 de marzo de 1969, el Gobierno español ordenó la evacuación de todos los españoles que aún quedaban en Guinea Ecuatorial (oficialmente República de Guinea Ecuatorial), con motivo de la proclamación de su independencia unos meses antes, el 12 de octubre de 1968, y tras haber crecido la tensión antiespañola durante el mes de febrero y marzo.
Dos Compañías Móviles de la Guardia Civil se mantuvieron en el nuevo país independiente para proteger a los ciudadanos españoles y colaborar con el nuevo Gobierno guineano. Así mismo, permanecerían en Guinea la fragata «Pizarro» y la corbeta «Descubierta», con tropas de Infantería de Marina y una Escuadrilla Mixta del Ejército del Aire.
Ante el complicado clima social y de inseguridad, los españoles que aún no habían podido salir del país se resguardaron en los cuarteles de la Guardia Civil de Santa Isabel (actual Malabo) y de Bata mientras se preparaba la operación de evacuación, que sería desarrollada con ayuda de la Armada.
El 28 de marzo se produjo el último arriado de la Bandera de España en el territorio continental de Guinea Ecuatorial, abandonándose completamente la isla de Fernando Poo (actual Bioko) unos días más tarde. El comandante del Cuerpo Luis Báguena Salvador, los miembros de sus dos Compañías, así como los Infantes de Marina de la Armada Española que colaboraron en la operación y que habían organizado la peligrosa salida de españoles, abandonaron el país en las dos últimas embarcaciones enviadas tras cumplir con su misión.
El 5 de abril de 1969 se dio por concluida la presencia española en el Golfo de Guinea, la cual se remontaba al siglo XVIII.
Las primeras asistencias técnicas internaciones del Cuerpo de la Guardia Civil habían tenido lugar tras el proceso de emancipación de los distintos Estados hispanoamericanos. En dicho contexto, España asistió a varios países en el diseño y organización de su seguridad pública. En concreto, la Guardia Civil prestó asistencia en el ámbito de sus competencias durante los procesos de creación de cuerpos policiales similares a la Benemérita en los siguientes Estados:
- Guatemala: año 1894 (durante la fase de planeamiento, el proyecto se suspendió por el magnicidio del presidente guatemalteco José María Reina Barrios).
- El Salvador: años 1912-1926.
- Colombia: años 1916-1920.
- Costa Rica: años 1920-1921.
- Perú: años 1921-1949.
- Venezuela: años 1936-1940.
